Il 3-mercaptopropiltrietossisilano è un organosilano bifunzionale che possiede un mercapto organico reattivo e un gruppo metossisilile inorganico idrolizzabile. Il 3-mercaptopropiltrietossisilano è un liquido limpido, da incolore a giallo chiaro con un odore leggermente di mercaptano. È solubile in alcoli, chetoni e idrocarburi alifatici o aromatici.
